Ракун-сити контролируется влиятельной корпорацией «Амбрелла». После бактериологической катастрофы жители медленно превращаются в зомби, а те немногочисленные граждане, чей разум ещё не до конца изъеден ужасным вирусом, доживают последние дни в атмосфере страха и с желанием скорейшей смерти.

Пять лет спустя борец с экологическими преступлениями Джонас Тейлор вместе сотрудниками компании-владельца глубоководной станции опускается на дно Марианской впадины, где миллионы лет существует скрытая экосистема с невиданными существами и обитают гигантские акулы. На месте выясняется, что станция захвачена группой наёмников, которые незаконно ведут добычу особо ценных ископаемых.